Ozonun uygulanmasının yasak olduğu hastalıklar son derece sınırlıdır.
1-Favizm;alyuvarlarda bir enzim eksikliği ile seyreden (Glukoz 6 fosfat dehidrogenz enzim eksikliği) hastalıkta
2-Aşırı alkol kullananlarda
3-Hipertroidi;troid bezi aşırı çalışanlarda
4-İleri derecede kansızlık ve kanla ilgili bazı rahatsızlığı (hemofili,kanama pıhtılaşma hastalıkları v.s.) olan hastalara uygulama yapılmaz
5-Kronik ve tekrarlayıcı pankreas bezi iltihaplarında (Pankreatitler)
6-yeni gelişmiş kalp enfarktüsü ve kanamanın aktif olarak devam ettiği beyin felci gibi bazı hastalıklar
7-Ozona karşı alerjisi veya intoleransı olanlarda (çok nadir görülen bir durum olup daha ziyade kokuya olan tahammülsüzlükler de oluşabilir) Bu bakımdan uygulama öncesi bazı laboratuar analizleri yapılarak durum denetlenmelidir.